11.01.2024 19:41 
900
900
В России разработали программу дизайна фрагментов ДНК для более точной диагностики рака
В Передовой инженерной школе (ПИШ) НГУ была создана программа под названием "Олигодизайнер", которая предназначена для дизайна коротких фрагментов ДНК - олигонуклеотидов. Эти фрагменты необходимы для проведения диагностики онкологических заболеваний с использованием секвенирования нового поколения (NGS).
Врачи онкоцентра теперь могут самостоятельно формировать нуклеотидные последовательности, которые необходимы для установления диагноза у конкретного пациента. Об этом сообщила Ольга Науменко, руководитель центра компетенций ПИШ НГУ "Биотехнологии и микрофлюидика", в пресс-центре ТАСС. Программа "Олигодизайнер" позволяет осуществлять дизайн олигонуклеотидов для интересующих врачей областей генома с целью проведения диагностики.
По словам Науменко, программа формирует готовый файл с последовательностями нуклеотидов, который передается специализированной организации для синтеза олигонуклеотидов. Она отметила, что в настоящее время в России эти компоненты, необходимые для NGS-секвенирования, не синтезируются и заказываются за рубежом. Науменко также добавила, что дизайна также не происходило в России, поэтому решение этой задачи является актуальной проблемой для преодоления технологического барьера.
По ее словам, для выявления генетических нарушений, которые являются причиной онкологических заболеваний, используются молекулярно-генетические методы диагностики. Полученные результаты диагностики необходимы для точного диагноза, выбора оптимальной стратегии лечения и применения таргетированной терапии, что позволяет избежать назначения неэффективных и дорогостоящих методов лечения. Метод NGS-секвенирования позволяет одновременно исследовать множество геномических областей, в которых нарушения могут быть связаны с развитием онкологических заболеваний. Студенты НГУ уже работают с программой для создания новых панелей олигонуклеотидов.
Врачи смогут использовать программу для подбора актуальных реагентов для диагностики и лечения пациентов. Науменко пояснила, что работа в "Олигодизайнере" не требует специализированных знаний в области биоинформатики и программирования. Кроме того, в центре компетенций разрабатывается курс дополнительного профессионального образования для врачей, чтобы обучить их работе с программой.
В процессе использования программа будет обучаться на данных, полученных в результате секвенирования, что позволит создавать улучшенные версии олигонуклеотидов для более точной диагностики.
Источник: https://nauka.tass.ru
По словам Науменко, программа формирует готовый файл с последовательностями нуклеотидов, который передается специализированной организации для синтеза олигонуклеотидов. Она отметила, что в настоящее время в России эти компоненты, необходимые для NGS-секвенирования, не синтезируются и заказываются за рубежом. Науменко также добавила, что дизайна также не происходило в России, поэтому решение этой задачи является актуальной проблемой для преодоления технологического барьера.
По ее словам, для выявления генетических нарушений, которые являются причиной онкологических заболеваний, используются молекулярно-генетические методы диагностики. Полученные результаты диагностики необходимы для точного диагноза, выбора оптимальной стратегии лечения и применения таргетированной терапии, что позволяет избежать назначения неэффективных и дорогостоящих методов лечения. Метод NGS-секвенирования позволяет одновременно исследовать множество геномических областей, в которых нарушения могут быть связаны с развитием онкологических заболеваний. Студенты НГУ уже работают с программой для создания новых панелей олигонуклеотидов.
Врачи смогут использовать программу для подбора актуальных реагентов для диагностики и лечения пациентов. Науменко пояснила, что работа в "Олигодизайнере" не требует специализированных знаний в области биоинформатики и программирования. Кроме того, в центре компетенций разрабатывается курс дополнительного профессионального образования для врачей, чтобы обучить их работе с программой.
В процессе использования программа будет обучаться на данных, полученных в результате секвенирования, что позволит создавать улучшенные версии олигонуклеотидов для более точной диагностики.
Источник: https://nauka.tass.ru
